Guatemala, og hele Mellom-Amerika, ligger over tre tektoniske plater (kontinentalplater), og regionen har vokst frem som resultat av vulkansk aktivitet mellom disse platene. Dette geologiske grunnlaget forklarer den høye vulkanske- og jordskjelvsaktiviteten. Landet opplever ofte svake rystninger, siste store jordskjelv med dramatiske følger rammet landet i 1976. Det forklarer også det vulkanske landskapet, Guatemala har 37 vulkaner hvorav 4 er aktive.
Guatemala sin posisjon mellom den Karibiske Gulf og Stillehavet gjør det også spesielt utsatt for tropiske regnstormer og orkaner med påfølgende flom og jordskred, særlig under regntiden (mai - november). Orkaner rammer som oftest kyststrøkene hardest, mens flom og jordskred som følge av tung nedbør også rammer høylandet. De siste store naturkatastrofene landet har opplevd er orkanen Mitch i 1998, og regnstormen Stan i oktober 2005.
For oppdatert informasjon, se hjemmesiden til den Guatemalanske Koordinatoren for Krisereduksjon CONRED. Der legges det ut aktuell informasjon om både lokale og nasjonale krisesituasjoner.