Studier gjennomført av miljøeksperter i samarbeid med organisasjonen "Todos por el Lago" bekrefter mistanken om det høye forurensingsnivået. Vannet i innsjøen er ikke trygt for hverken bading, matlaging eller som drikkevann.
Innsjøen har sett en oppblomstring av cyanobakterier, en gruppe bakterier som blir kalt alger og der flere arter er gifitge. Siden studier av vannet viser høyt nivå av oppløst oksygen i vannkappene, samt ett rikt ressursgrunnlag for algeveksten, beviser dette at cianobakteriene fortsatt befinner seg i en vekstfase.
Årsaken til forurensingen er innførsel va avfallstoffer direkte til vannet, slik som avslagsvann, avrenning fra jordbruk: menneskelig, industrielt og kjemisk avfall.